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Genbank将收录水稻基因组数据

2018-12-03 14:52:58

Genbank将收录水稻基因组数据

[生物通讯]Syngenta公司上周四宣布,公司将在接下来的12到18个月内与公共资助的研究实验室合作来完成水稻基因组99.99%的测序工作,Genbank将收录测序所得数据。

但同时,这家世界上的农业生物公司之一还将实现现有序列的商业价值。

当前的这个粳稻(japonica)基因组序列草图,12条染色体上4亿2千万个碱基对约隐藏有45,000个基因,有关数据可在Torrey

Mesa研究院站上免费获得。

“我们今天呈现的图谱其精确度只有99.8%。”Syngenta基因组学负责人Steven

Briggs表示。“下一步我们将要做的是与北京中科院以及国际水稻基因组测序计划的成员合作以绘制出一个完整的、精确度达到99.99%的水稻基因组图谱,当然其中会包含我们自己的数据。”

“我们还将支持将终测序结果存入Genbank的做法,”他宣称。“现在就将序列信息存入Genbank是不成熟的做法,这是因为现在它会为Syngenta巨大的商业价值。但我们认为用12到18个月的时间来完成一件对于人类更为重要的事情将是我们愿意完成的心愿。”

北京华大基因组中心的研究人员已经在《科学》杂志上发表了他们完成的籼稻基因组草图,而Syngenta公司测序的是另一水稻主要栽培亚种粳稻。

Briggs是在下午与华盛顿大学基因组中心的高级研究人员Gane

Ka-Shu Wong以及《科学》杂志的主编Don

Kennedy进行的一次会议上做上述表示的。

在进行Syngenta声称的“耗资了千万美金”的水稻基因组计划时,公司还注意到大约98%的玉米、小麦以及大麦基因也存在于水稻基因组中。这个发现使得公司在这些谷物中定位了超过2000个性状。

“这意味着这些物种染色体彼此之间有一个“统一战线”,他说。”因此,任何给定区域,拿玉米来说,我们都能在水稻基因组中找到对应位置,并识别出存在于该区域的所有基因。”

生物通摘译自GENOMEWEB

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